2. Thrive
3. Thrive Game
4. Turkish

[ul]Compounds are the materials that the world and organisms are made of. So, stuff like elemental compounds (like carbon), natural resources (salt, water), organic compounds (amino acids) and organic polymers (proteins).
Later, there will be composites (bone, muscle) made up of other compounds combined.
The end products are things like the cell membrane, and can be treated just like compounds. Another important end product is energy.
Compounds exist in several states in the environment:[/ul]

[ul]No compounds enter or leave the total ecosystem.
Compounds can change form (e.g. breaking down water into hydrogen and oxygen)
Compound clouds are based on a grid representation of environmental resources. Their concentration can vary, and with higher concentration comes a cloud with a more intense colour.[/ul]

[b][u]Organelles[/u][/b]

[ul]This is where processes generally take place. Some processes require certain organelles. They can vary depending on the quality of the organelle.
In later stages, this would be organs, workshops/factories and cities.[/ul]

[b][u]Collection and Storage[/u][/b]

[ul]Amount of compounds in a system measured in a unit based on moles
Each compound has a weight. This affects how much storage space it takes up in a cell.
Compounds are automatically absorbed by microbes by swimming through them, if the microbe has space to store it. They are stored in the cytoplasm or in vacuoles.
Vacuoles can be designated to only store specific compounds.[/ul]

[b][u]Priority System[/u][/b]

Because storage is just going to be general, there need to be priorities on what compounds get stored and which ones to eject first in case the storage is filled.

[b][u]Processes[/u][/b]

[ul]These control how compounds are converted from one to another, and what is required to do so. If an organism isn't capable of carrying out a particular process, it may not have access to that process' products, and will need to acquire them some other way (probably by eating something), or may not be able to acquire them at all (for example, eating a rhino horn doesn't allow you to grow one yourself).
The processes you're able to carry out, and how effectively you can do so, define your organism, your species, and your place in the food chain.
Not all processes will be available at the beginning and the player will need to get certain organelles in order to unlock them.[/ul]

[b][u]Agents[/u][/b]

[ul]Agents are special compounds with powerful effects, and most are made from the same constituents for the sake of simplicity. Converting incoming compounds into agents is done using the golgi apparatus and endoplasmic reticulum, which consume ATP at a fixed rate whether performing this task or not.
More details on the Agents page.[/ul]

[b][u]Organisms[/u][/b]

[ul]Organisms are individuals of a species, whether it be a cell, plant, or creature.
Each has particular organelles/organs, is capable of particular processes, can store particular compounds, and considers others to be waste products.
Each one continually carries out the processes it is capable of in order to produce the compounds it needs.
A compound can be a nutrient for one species and not for another.[/ul]

[b][u]Implementation[/u][/b]

[b][u]Phase 1: Calculating the Prices[/u][/b]

[ul]At the beginning of the update method, each process calculates its price, and the price function is a function of the demand, the supply, and the previous price of the compound.[/ul]

In the current implementation the function is:

[code]P = √(D / (S + 1)) * COMPOUND_PRICE_MOMENTUM + oldP * (1 - COMPOUND_PRICE_MOMENTUM))[/code]

With:
[code]P[/code] the price
[code]D[/code] the demand
[code]S[/code] the supply
[code]oldP[/code] the old price
[code]COMPOUND_PRICE_MOMENTUM[/code] a constant between 0 and 1.


The function also performs a check to raise the value from 0 to a small positive number if needed.

[ul]After that's done, if the compound is marked as “useful” (this is done on the compound table), then the price gets inflated by a certain amount, depending on the compound supply. This is done so that the process system knows which compounds does it want to make (otherwise all prices would decay to 0 and that would be no fun).[/ul]

In the current implementation, the price inflating function is:

[code]PI = IMPORTANT_COMPOUND_BIAS / (S + 1)[/code]

With:
[code]PI[/code] the price inflation
[code]S[/code] the supply
[code]IMPORTANT_COMPOUND_BIAS[/code] an arbitrary constant


It’s important to notice that for the first price equation the old price used is the non-inflated one.
If, after all that, the price is below a certain small number, then the price is rounded down to zero (and therefore dumped later).

[b][u]Phase 2: Calculating the Rate[/u][/b]

[ul]After all those calculations are done for all of the compounds, the process system needs to decide the desired rate for each of the processes.
This rate could, potentially, be larger than the maximum capacity the process has.
Said rate is calculated by making a simple prediction about the prices of the compounds, by replicating the same calculations of phase 1 on each compound, but assuming the supply is one unit larger, and then assuming the price is linear in respect of the supply.
If the price of the compound was 0 on phase 1 it’s assumed that the price of that compound is always 0, regardless of the supply.
Finally, it’s assumed that the price is 0 for any value of supply that the linearization would make it’s price negative (aka, the minimum value of a function is 0).
Here’s an example of one of those functions, made in the google drive equivalent of MS Paint:[/ul]

[ul]Then all the process system has to do is get the rate at which the sum of all the input compound prices would equal the sum of all the output compound prices, and that is the desired rate.
If all of the output compounds have a price of 0, then the desired rate is made 0.
An example of a process would be like this:[/ul]

*To account for the storage space, a similar calculation is made but multiplying the prices of the compounds by a function that returns a value between 0.0 and 1.0, depending on the available space and the size and amount of the compounds processed.

In the current implementation, the function is:

[code]M = 2.0 * (1.0 - sigmoid(RS / (AS + 1.0) * STORAGE_SPACE_MULTIPLIER));[/code]

With:
[code]M[/code] is the multiplier between 0 and 1.
[code]RS[/code] is the required space of the compound (volume * amount produced/processed)
[code]AS[/code] is the available storage space
[code]STORAGE_SPACE_MULTIPLIER[/code] is an arbitrary constant (currently 2.0)

[ul]Then the inputs get converted into the outputs by a rate of the minimum of the desired rate considering the storage space ONLY if by doing so the rate is reduced, otherwise the space is not considered (this is to avoid the process system to destroy compounds to gain space, when the compound purging code should do that), and the max capacity of the process (assuming there are enough inputs and storage space to do so).[/ul]

[b][u]Phase 3: Calculating the Demand[/u][/b]

[ul]After the desired rates are found, the process must determine the demand of the compounds.
The demand of a compound is equal to the sum of all the demands generated by all the processes, which is defined by the equation[/ul]

[code]D = DR * IN * soft(PC * IN)[/code]

with:
[code]D[/code] the demand generated by a process.
[code]DR[/code] the desired rate of that process (without capacity, input or storage space limitations being considered).
[code]IN[/code] the input needed by the process (aka the amount of input spent on running the process at a rate of 1).
[code]PC[/code] the maximum process capacity
[code]soft(x)[/code] a continuous, monotonically increasing function that equals 0 when x = 0, and 1 when x ⟶ ∞

In the current implementation:

[code]soft(x) = 2 * sigmoid(x * PROCESS_CAPACITY_DEMAND_MULTIPLIER) - 1[/code]

with [code]PROCESS_CAPACITY_DEMAND_MULTIPLIER[/code] being an arbitrary constant.

[ul]It’s important to note that a process like A ⟶ B, with a rate of 2 * x it’s exactly the same as the process 2 * A ⟶ 2 * B, with a rate of x
It’s also important that processes with a max capacity of 0 do not affect the system in any way.
That’s it! :D[/ul]

[ul]Bileşikler, dünya ve organizmaların yapıldığı malzemelerdir. Yani, bunlar temel bileşikler (karbon gibi), doğal kaynaklar (tuz, su), organik bileşikler (amino asitler) ve organik polimerlerdir (proteinler).
Daha sonra, diğer bileşiklerin birleştirilmesiyle oluşan kompozitler (kemik, kas) vardır.
Son ürünler, hücre zarı gibi şeylerdir ve bunlar bileşikler gibi ele alınabilir. Diğer önemli son ürün ise, enerjidir.
Bileşikler ortamda birkaç halde bulunur:[/ul]

[ul]Hiçbir bileşik, toplam ekosisteme girmez veya ekosistemden çıkmaz.
Bileşikler şekil değiştirebilir (örneğin, suyu hidrojen ve oksijene ayırmak).
Bileşik bulutları, çevresel kaynakların bir ızgara düzenine dayanır. Konsantrasyonları değişebilir ve daha yüksek konsantrasyonda bu bileşikler daha yoğun bir renge sahip bir bulut haline gelebilir.[/ul]

[b][u]Organeller[/u][/b]

[ul]İşlemlerin genellikle gerçekleştiği yer burasıdır. Bazı işlemler belli organellere ihtiyaç duyar. İşlemler, organellerin kalitesine göre değişebilir.
Sonraki evrelerde, bu organeller; organlar, atölyeler/fabrikalar ve şehirler olarak geçer.[/ul]

[b][u]Koleksiyon ve Depo[/u][/b]

[ul]Bir sistemdeki bileşiklerin miktarı, mol birimine dayalı olarak ölçülür.
Her bileşiğin bir ağırlığı vardır. Bu durum, bileşiğin hücrede ne kadar depo alanı kaplayacağını etkiler.
Eğer bir mikrobun depolamak için yeri varsa, üzerine doğru yüzdüğü bileşikler otomatik olarak bu mikrop tarafından emilir. Bu bileşikler, sitoplazmada veya kofullarda depolanır.
Kofullar yalnızca belirli bileşikleri depolamak üzere görevlendirilebilir.[/ul]

[b][u]Öncelik Sistemi[/u][/b]

Depolama kapsamlı olacağı için ne tür bileşiklerin depolanacağına ve deponun dolu olduğu bir durumda ilk hangilerinin dışarı atılacağına yönelik önceliklerin olması gerekmektedir.

[b][u]İşlemler[/u][/b]

[ul]Bunlar, bileşiklerin birinden diğerine nasıl dönüştürüleceğini ve bunu yapmak için neler gerektiğini kontrol eder. Eğer bir organizma belirli bir işlemi gerçekleştiremiyorsa, o işlemin ürünlerine erişemiyor olabilir. Bu organizmanın, ürünleri başka bir şekilde (muhtemelen bir şeyleri yiyerek) elde etmesi gerekebilir ya da hiç elde edemeyebilir (örneğin, bir gergedan boynuzu yemek, sizin de bir boynuz çıkarmanızı sağlamaz).
Gerçekleştirebildiğiniz işlemler ve bunlardaki etkinliğiniz, organizmanızı, türünüzü ve besin zincirindeki yerinizi tanımlar.
Başlangıçta, tüm işlemler mevcut değildir ve oyuncu, bunların kilidini açmak için belirli organeller elde etmek zorundadır.[/ul]

[b][u]Ajanlar[/u][/b]

[ul]Ajanlar, güçlü etkileri olan özel bileşiklerdir ve, oyunun sade olması adına, çoğu aynı bileşenlerden yapılır. Giren bileşikleri ajanlara dönüştürme işlemi, sabit bir hızda ATP tüketen golgi aygıtı ve endoplazmik retikulum kullanılarak yapılır ve ATP tüketimi, bu görevin yerine getirilip getirilmemesine bağlı değildir.
Daha fazla ayrıntı, Ajanlar sayfasında bulunmaktadır.[/ul]

[b][u]Organizmalar[/u][/b]

[ul]Organizmalar; ister hücre, ister bitki, ister bir canlı olsun, bir türün bireyleridir.
Her bir organizmanın belirli organelleri/organları vardır, her biri belirli işlemleri gerçekleştirebilir, belirli bileşikleri depolayabilir ve diğer bileşikleri atık ürün olarak kabul edebilir.
Her bir organizma, ihtiyaç duyduğu bileşikleri üretmek için yapabileceği işlemleri sürekli olarak gerçekleştirir.
Bir bileşik, bir tür için besin olabilir, ancak başka bir tür için olmayabilir.[/ul]

[b][u]Uygulama[/u][/b]

[b][u]Aşama 1: Maliyetlerin Hesaplanması[/u][/b]

[ul]Güncelleme metodunun başında, her işlem kendi maliyetini hesaplar ve maliyet fonksiyonu, bileşiğin talebinin, stoğunun ve önceki maliyetinin bir fonksiyonudur.[/ul]

Mevcut uygulamada, fonksiyon aşağıdaki gibidir:

[code]P = √(D / (S + 1)) * COMPOUND_PRICE_MOMENTUM + oldP * (1 - COMPOUND_PRICE_MOMENTUM))[/code]

Bununla beraber:
[code]P[/code] maliyet,
[code]D[/code] talep,
[code]S[/code] stok,
[code]oldP[/code] eski maliyet,
[code]COMPOUND_PRICE_MOMENTUM[/code] 0 ile 1 arasında bir sabittir.


Bu fonksiyon ayrıca gerektiğinde, bu değeri 0'dan, küçük bir pozitif sayıya yükseltmek için bir kontrol yapar.

[ul]Bu fonksiyon yapıldıktan sonra, bileşik “kullanışlı” olarak işaretlenirse (bu, bileşik tablosunda yapılır), o zaman maliyet, bileşik stoğuna bağlı olarak belirli bir miktar şişirilir. Bu eylem, işlem sisteminin hangi bileşikleri yapmak istediğini bilmesi için yapılır (aksi takdirde, tüm maliyetler 0'a düşerdi ve bu hiç eğlenceli olmazdı).[/ul]

Mevcut uygulamada, parasal değerin yükseltilmesi fonksiyonu aşağıdaki gibidir:

[code]PI = IMPORTANT_COMPOUND_BIAS / (S + 1)[/code]

Bununla birlikte:
[code]PI[/code] maliyet enflasyonu,
[code]S[/code] stok,
[code]IMPORTANT_COMPOUND_BIAS[/code] keyfi bir sabittir.


İlk maliyet denkleminde kullanılan eski maliyetin şişirilmemiş bir maliyet olduğunu unutmamak önemlidir.
Eğer, bütün bunlardan sonra, maliyet belirli bir küçük sayının altındaysa, bu maliyet sıfıra yuvarlanır (ve, bu nedenle, sonradan atılır).

[b][u]Aşama 2: Hızın Hesaplanması[/u][/b]

[ul]Tüm bu hesaplamalar bütün bileşikler için yapıldıktan sonra, işlem sisteminin her bir işlem için istenen hızı belirlemesi gerekir.
Bu hız, potansiyel olarak, işlemin maksimum kapasitesinden daha büyük olabilir.
Bahsedilen hız, bileşiklerin maliyetleri hakkında basit bir tahmin yapılarak ve aşama 1'deki bileşiklerin her biri üzerinde aynı hesaplamalar tekrarlanarak hesaplanır. Ancak bu hesaplama, stoğun bir birim daha büyük olduğu ve ardından maliyetin stokla doğru orantılı olduğu varsayılarak yapılır.
Eğer bileşiğin maliyeti aşama 1'de 0 ise, stoktan bağımsız olarak, bu bileşiğin maliyetinin her zaman 0 olduğu varsayılır.
Son olarak, doğrusallaştırmanın, maliyetini negatif yapacağı herhangi bir stok değeri için maliyetin her zaman 0 olduğu varsayılır (yani, bir fonksiyonun minimum değeri 0'dır).
İşte bu fonksiyonlardan birinin örneği, google drive'ın MS Paint eşdeğeri ile yapılmıştır:[/ul]

[ul]Ardından, işlem sisteminin yapması gereken tek şey, tüm giren bileşiklerin maliyetlerinin toplamının tüm çıkan bileşiklerin maliyetlerinin toplamına eşit olacağı hız değerini elde etmektir ve bu istenen hızdır.
Tüm çıkan bileşiklerin maliyeti 0 ise, istenen hız 0 yapılır.
Bir işlemin örneği şu şekildedir:[/ul]

*Depolama alanını hesaba katmak için benzer bir hesaplama yapılır. Ancak bileşiklerin maliyetleri, mevcut alan ile işlenen bileşiklerin boyutu ve miktarına bağlı olarak, 0.0 ile 1.0 arasında bir değer döndüren bir fonksiyonla çarpılarak yapılır.

Mevcut uygulamada, fonksiyon aşağıdaki gibidir:

[code]M = 2.0 * (1.0 - sigmoid(RS / (AS + 1.0) * STORAGE_SPACE_MULTIPLIER));[/code]

Bununla birlikte:
[code]M[/code] 0 ile 1 arasında bir çarpan,
[code]RS[/code] bileşik için gerekli depo alanı (hacim * üretilen/işlenen miktar),
[code]AS[/code] mevcut olan depo alanı,
[code]STORAGE_SPACE_MULTIPLIER[/code] keyfi bir sabittir (şu an için 2.0'dir).

[ul]Daha sonra girenler, depolama alanı dikkate alınarak, YALNIZCA istenen hızın azaltılması kaydıyla, istenen hızın minimumu oranında çıkanlara ve işlemin maksimum kapasitesine (girenlerin ve depolama alanının yeterli olduğu varsayılarak) dönüştürülür. Aksi takdirde, bu alan dikkate alınmaz (bu eylem, işlem sisteminin alan kazanmak için bileşikleri yok etmesini engellemek içindir, o sırada bileşik temizleme kodu bunu yapmalıdır).[/ul]

[b][u]Aşama 3: Talebin Hesaplanması[/u][/b]

[ul]İstenen hızlar bulunduktan sonra, işlem, bileşiklerin talebini belirlemelidir.
Bir bileşiğin talebi, bütün işlemler tarafından oluşturulan taleplerin toplamına eşittir ve bu formül, aşağıdaki denklem ile tanımlanır:[/ul]

[code]D = DR * IN * soft(PC * IN)[/code]

Bununla birlikte:
[code]D[/code] bir işlemden gelen talep,
[code]DR[/code] o işlemden beklenen hız (kapasite olmadığında, giren ürün veya depo alanı kısıtlamaları göz önüne alınır),
[code]IN[/code] işlem tarafından gerekli olan giren ürün (diğer adıyla, işlemi 1 hızında çalıştırmak için harcanan giren ürün miktarı),
[code]PC[/code] maksimum işlem kapasitesi,
[code]soft(x)[/code], x = 0 olduğunda 0'a, x ⟶ ∞ olduğunda 1'e eşit olan ve sürekli, monoton artan bir fonksiyondur.

Mevcut uygulamada:

[code]soft(x) = 2 * sigmoid(x * PROCESS_CAPACITY_DEMAND_MULTIPLIER) - 1[/code]

Bununla birlikte, [code]PROCESS_CAPACITY_DEMAND_MULTIPLIER[/code] keyfi bir sabittir.

[ul]Şunu belirtmek gerekir ki, 2 * x hızındaki A ⟶ B gibi bir işlem, x hızındaki 2 * A ⟶ 2 * B işlemine tamamen eşittir.
Ayrıca, maksimum kapasitesi 0 olan işlemlerin, sistemi hiçbir şekilde etkilemediği de önemlidir.
Hepsi bu kadar! :D[/ul]

WIKI_COMPOUND_SYSTEM_DEVELOPMENT_MICROBE_STAGE

[ul]Compounds are the materials that the world and organisms are made of. So, stuff like elemental compounds (like carbon), natural resources (salt, water), organic compounds (amino acids) and organic polymers (proteins).
Later, there will be composites (bone, muscle) made up of other compounds combined.
The end products are things like the cell membrane, and can be treated just like compounds. Another important end product is energy.
Compounds exist in several states in the environment:[/ul]

[ul]No compounds enter or leave the total ecosystem.
Compounds can change form (e.g. breaking down water into hydrogen and oxygen)
Compound clouds are based on a grid representation of environmental resources. Their concentration can vary, and with higher concentration comes a cloud with a more intense colour.[/ul]

[b][u]Organelles[/u][/b]

[ul]This is where processes generally take place. Some processes require certain organelles. They can vary depending on the quality of the organelle.
In later stages, this would be organs, workshops/factories and cities.[/ul]

[b][u]Collection and Storage[/u][/b]

[ul]Amount of compounds in a system measured in a unit based on moles
Each compound has a weight. This affects how much storage space it takes up in a cell.
Compounds are automatically absorbed by microbes by swimming through them, if the microbe has space to store it. They are stored in the cytoplasm or in vacuoles.
Vacuoles can be designated to only store specific compounds.[/ul]

[b][u]Priority System[/u][/b]

Because storage is just going to be general, there need to be priorities on what compounds get stored and which ones to eject first in case the storage is filled.

[b][u]Processes[/u][/b]

[ul]These control how compounds are converted from one to another, and what is required to do so. If an organism isn't capable of carrying out a particular process, it may not have access to that process' products, and will need to acquire them some other way (probably by eating something), or may not be able to acquire them at all (for example, eating a rhino horn doesn't allow you to grow one yourself).
The processes you're able to carry out, and how effectively you can do so, define your organism, your species, and your place in the food chain.
Not all processes will be available at the beginning and the player will need to get certain organelles in order to unlock them.[/ul]

[b][u]Agents[/u][/b]

[ul]Agents are special compounds with powerful effects, and most are made from the same constituents for the sake of simplicity. Converting incoming compounds into agents is done using the golgi apparatus and endoplasmic reticulum, which consume ATP at a fixed rate whether performing this task or not.
More details on the Agents page.[/ul]

[b][u]Organisms[/u][/b]

[ul]Organisms are individuals of a species, whether it be a cell, plant, or creature.
Each has particular organelles/organs, is capable of particular processes, can store particular compounds, and considers others to be waste products.
Each one continually carries out the processes it is capable of in order to produce the compounds it needs.
A compound can be a nutrient for one species and not for another.[/ul]

[b][u]Implementation[/u][/b]

[b][u]Phase 1: Calculating the Prices[/u][/b]

[ul]At the beginning of the update method, each process calculates its price, and the price function is a function of the demand, the supply, and the previous price of the compound.[/ul]

In the current implementation the function is:

[code]P = √(D / (S + 1)) * COMPOUND_PRICE_MOMENTUM + oldP * (1 - COMPOUND_PRICE_MOMENTUM))[/code]

With:
[code]P[/code] the price
[code]D[/code] the demand
[code]S[/code] the supply
[code]oldP[/code] the old price
[code]COMPOUND_PRICE_MOMENTUM[/code] a constant between 0 and 1.


The function also performs a check to raise the value from 0 to a small positive number if needed.

[ul]After that's done, if the compound is marked as “useful” (this is done on the compound table), then the price gets inflated by a certain amount, depending on the compound supply. This is done so that the process system knows which compounds does it want to make (otherwise all prices would decay to 0 and that would be no fun).[/ul]

In the current implementation, the price inflating function is:

[code]PI = IMPORTANT_COMPOUND_BIAS / (S + 1)[/code]

With:
[code]PI[/code] the price inflation
[code]S[/code] the supply
[code]IMPORTANT_COMPOUND_BIAS[/code] an arbitrary constant


It’s important to notice that for the first price equation the old price used is the non-inflated one.
If, after all that, the price is below a certain small number, then the price is rounded down to zero (and therefore dumped later).

[b][u]Phase 2: Calculating the Rate[/u][/b]

[ul]After all those calculations are done for all of the compounds, the process system needs to decide the desired rate for each of the processes.
This rate could, potentially, be larger than the maximum capacity the process has.
Said rate is calculated by making a simple prediction about the prices of the compounds, by replicating the same calculations of phase 1 on each compound, but assuming the supply is one unit larger, and then assuming the price is linear in respect of the supply.
If the price of the compound was 0 on phase 1 it’s assumed that the price of that compound is always 0, regardless of the supply.
Finally, it’s assumed that the price is 0 for any value of supply that the linearization would make it’s price negative (aka, the minimum value of a function is 0).
Here’s an example of one of those functions, made in the google drive equivalent of MS Paint:[/ul]

[ul]Then all the process system has to do is get the rate at which the sum of all the input compound prices would equal the sum of all the output compound prices, and that is the desired rate.
If all of the output compounds have a price of 0, then the desired rate is made 0.
An example of a process would be like this:[/ul]

*To account for the storage space, a similar calculation is made but multiplying the prices of the compounds by a function that returns a value between 0.0 and 1.0, depending on the available space and the size and amount of the compounds processed.

In the current implementation, the function is:

[code]M = 2.0 * (1.0 - sigmoid(RS / (AS + 1.0) * STORAGE_SPACE_MULTIPLIER));[/code]

With:
[code]M[/code] is the multiplier between 0 and 1.
[code]RS[/code] is the required space of the compound (volume * amount produced/processed)
[code]AS[/code] is the available storage space
[code]STORAGE_SPACE_MULTIPLIER[/code] is an arbitrary constant (currently 2.0)

[ul]Then the inputs get converted into the outputs by a rate of the minimum of the desired rate considering the storage space ONLY if by doing so the rate is reduced, otherwise the space is not considered (this is to avoid the process system to destroy compounds to gain space, when the compound purging code should do that), and the max capacity of the process (assuming there are enough inputs and storage space to do so).[/ul]

[b][u]Phase 3: Calculating the Demand[/u][/b]

[ul]After the desired rates are found, the process must determine the demand of the compounds.
The demand of a compound is equal to the sum of all the demands generated by all the processes, which is defined by the equation[/ul]

[code]D = DR * IN * soft(PC * IN)[/code]

with:
[code]D[/code] the demand generated by a process.
[code]DR[/code] the desired rate of that process (without capacity, input or storage space limitations being considered).
[code]IN[/code] the input needed by the process (aka the amount of input spent on running the process at a rate of 1).
[code]PC[/code] the maximum process capacity
[code]soft(x)[/code] a continuous, monotonically increasing function that equals 0 when x = 0, and 1 when x ⟶ ∞

In the current implementation:

[code]soft(x) = 2 * sigmoid(x * PROCESS_CAPACITY_DEMAND_MULTIPLIER) - 1[/code]

with [code]PROCESS_CAPACITY_DEMAND_MULTIPLIER[/code] being an arbitrary constant.

[ul]It’s important to note that a process like A ⟶ B, with a rate of 2 * x it’s exactly the same as the process 2 * A ⟶ 2 * B, with a rate of x
It’s also important that processes with a max capacity of 0 do not affect the system in any way.
That’s it! :D[/ul]

[ul]Bileşikler, dünya ve organizmaların yapıldığı malzemelerdir. Yani, bunlar temel bileşikler (karbon gibi), doğal kaynaklar (tuz, su), organik bileşikler (amino asitler) ve organik polimerlerdir (proteinler).
Daha sonra, diğer bileşiklerin birleştirilmesiyle oluşan kompozitler (kemik, kas) vardır.
Son ürünler, hücre zarı gibi şeylerdir ve bunlar bileşikler gibi ele alınabilir. Diğer önemli son ürün ise, enerjidir.
Bileşikler ortamda birkaç halde bulunur:[/ul]

[ul]Hiçbir bileşik, toplam ekosisteme girmez veya ekosistemden çıkmaz.
Bileşikler şekil değiştirebilir (örneğin, suyu hidrojen ve oksijene ayırmak).
Bileşik bulutları, çevresel kaynakların bir ızgara düzenine dayanır. Konsantrasyonları değişebilir ve daha yüksek konsantrasyonda bu bileşikler daha yoğun bir renge sahip bir bulut haline gelebilir.[/ul]

[b][u]Organeller[/u][/b]

[ul]İşlemlerin genellikle gerçekleştiği yer burasıdır. Bazı işlemler belli organellere ihtiyaç duyar. İşlemler, organellerin kalitesine göre değişebilir.
Sonraki evrelerde, bu organeller; organlar, atölyeler/fabrikalar ve şehirler olarak geçer.[/ul]

[b][u]Koleksiyon ve Depo[/u][/b]

[ul]Bir sistemdeki bileşiklerin miktarı, mol birimine dayalı olarak ölçülür.
Her bileşiğin bir ağırlığı vardır. Bu durum, bileşiğin hücrede ne kadar depo alanı kaplayacağını etkiler.
Eğer bir mikrobun depolamak için yeri varsa, üzerine doğru yüzdüğü bileşikler otomatik olarak bu mikrop tarafından emilir. Bu bileşikler, sitoplazmada veya kofullarda depolanır.
Kofullar yalnızca belirli bileşikleri depolamak üzere görevlendirilebilir.[/ul]

[b][u]Öncelik Sistemi[/u][/b]

Depolama kapsamlı olacağı için ne tür bileşiklerin depolanacağına ve deponun dolu olduğu bir durumda ilk hangilerinin dışarı atılacağına yönelik önceliklerin olması gerekmektedir.

[b][u]İşlemler[/u][/b]

[ul]Bunlar, bileşiklerin birinden diğerine nasıl dönüştürüleceğini ve bunu yapmak için neler gerektiğini kontrol eder. Eğer bir organizma belirli bir işlemi gerçekleştiremiyorsa, o işlemin ürünlerine erişemiyor olabilir. Bu organizmanın, ürünleri başka bir şekilde (muhtemelen bir şeyleri yiyerek) elde etmesi gerekebilir ya da hiç elde edemeyebilir (örneğin, bir gergedan boynuzu yemek, sizin de bir boynuz çıkarmanızı sağlamaz).
Gerçekleştirebildiğiniz işlemler ve bunlardaki etkinliğiniz, organizmanızı, türünüzü ve besin zincirindeki yerinizi tanımlar.
Başlangıçta, tüm işlemler mevcut değildir ve oyuncu, bunların kilidini açmak için belirli organeller elde etmek zorundadır.[/ul]

[b][u]Ajanlar[/u][/b]

[ul]Ajanlar, güçlü etkileri olan özel bileşiklerdir ve, oyunun sade olması adına, çoğu aynı bileşenlerden yapılır. Giren bileşikleri ajanlara dönüştürme işlemi, sabit bir hızda ATP tüketen golgi aygıtı ve endoplazmik retikulum kullanılarak yapılır ve ATP tüketimi, bu görevin yerine getirilip getirilmemesine bağlı değildir.
Daha fazla ayrıntı, Ajanlar sayfasında bulunmaktadır.[/ul]

[b][u]Organizmalar[/u][/b]

[ul]Organizmalar; ister hücre, ister bitki, ister bir canlı olsun, bir türün bireyleridir.
Her bir organizmanın belirli organelleri/organları vardır, her biri belirli işlemleri gerçekleştirebilir, belirli bileşikleri depolayabilir ve diğer bileşikleri atık ürün olarak kabul edebilir.
Her bir organizma, ihtiyaç duyduğu bileşikleri üretmek için yapabileceği işlemleri sürekli olarak gerçekleştirir.
Bir bileşik, bir tür için besin olabilir, ancak başka bir tür için olmayabilir.[/ul]

[b][u]Uygulama[/u][/b]

[b][u]Aşama 1: Maliyetlerin Hesaplanması[/u][/b]

[ul]Güncelleme metodunun başında, her işlem kendi maliyetini hesaplar ve maliyet fonksiyonu, bileşiğin talebinin, stoğunun ve önceki maliyetinin bir fonksiyonudur.[/ul]

Mevcut uygulamada, fonksiyon aşağıdaki gibidir:

[code]P = √(D / (S + 1)) * COMPOUND_PRICE_MOMENTUM + oldP * (1 - COMPOUND_PRICE_MOMENTUM))[/code]

Bununla beraber:
[code]P[/code] maliyet,
[code]D[/code] talep,
[code]S[/code] stok,
[code]oldP[/code] eski maliyet,
[code]COMPOUND_PRICE_MOMENTUM[/code] 0 ile 1 arasında bir sabittir.


Bu fonksiyon ayrıca gerektiğinde, bu değeri 0'dan, küçük bir pozitif sayıya yükseltmek için bir kontrol yapar.

[ul]Bu fonksiyon yapıldıktan sonra, bileşik “kullanışlı” olarak işaretlenirse (bu, bileşik tablosunda yapılır), o zaman maliyet, bileşik stoğuna bağlı olarak belirli bir miktar şişirilir. Bu eylem, işlem sisteminin hangi bileşikleri yapmak istediğini bilmesi için yapılır (aksi takdirde, tüm maliyetler 0'a düşerdi ve bu hiç eğlenceli olmazdı).[/ul]

Mevcut uygulamada, parasal değerin yükseltilmesi fonksiyonu aşağıdaki gibidir:

[code]PI = IMPORTANT_COMPOUND_BIAS / (S + 1)[/code]

Bununla birlikte:
[code]PI[/code] maliyet enflasyonu,
[code]S[/code] stok,
[code]IMPORTANT_COMPOUND_BIAS[/code] keyfi bir sabittir.


İlk maliyet denkleminde kullanılan eski maliyetin şişirilmemiş bir maliyet olduğunu unutmamak önemlidir.
Eğer, bütün bunlardan sonra, maliyet belirli bir küçük sayının altındaysa, bu maliyet sıfıra yuvarlanır (ve, bu nedenle, sonradan atılır).

[b][u]Aşama 2: Hızın Hesaplanması[/u][/b]

[ul]Tüm bu hesaplamalar bütün bileşikler için yapıldıktan sonra, işlem sisteminin her bir işlem için istenen hızı belirlemesi gerekir.
Bu hız, potansiyel olarak, işlemin maksimum kapasitesinden daha büyük olabilir.
Bahsedilen hız, bileşiklerin maliyetleri hakkında basit bir tahmin yapılarak ve aşama 1'deki bileşiklerin her biri üzerinde aynı hesaplamalar tekrarlanarak hesaplanır. Ancak bu hesaplama, stoğun bir birim daha büyük olduğu ve ardından maliyetin stokla doğru orantılı olduğu varsayılarak yapılır.
Eğer bileşiğin maliyeti aşama 1'de 0 ise, stoktan bağımsız olarak, bu bileşiğin maliyetinin her zaman 0 olduğu varsayılır.
Son olarak, doğrusallaştırmanın, maliyetini negatif yapacağı herhangi bir stok değeri için maliyetin her zaman 0 olduğu varsayılır (yani, bir fonksiyonun minimum değeri 0'dır).
İşte bu fonksiyonlardan birinin örneği, google drive'ın MS Paint eşdeğeri ile yapılmıştır:[/ul]

[ul]Ardından, işlem sisteminin yapması gereken tek şey, tüm giren bileşiklerin maliyetlerinin toplamının tüm çıkan bileşiklerin maliyetlerinin toplamına eşit olacağı hız değerini elde etmektir ve bu istenen hızdır.
Tüm çıkan bileşiklerin maliyeti 0 ise, istenen hız 0 yapılır.
Bir işlemin örneği şu şekildedir:[/ul]

*Depolama alanını hesaba katmak için benzer bir hesaplama yapılır. Ancak bileşiklerin maliyetleri, mevcut alan ile işlenen bileşiklerin boyutu ve miktarına bağlı olarak, 0.0 ile 1.0 arasında bir değer döndüren bir fonksiyonla çarpılarak yapılır.

Mevcut uygulamada, fonksiyon aşağıdaki gibidir:

[code]M = 2.0 * (1.0 - sigmoid(RS / (AS + 1.0) * STORAGE_SPACE_MULTIPLIER));[/code]

Bununla birlikte:
[code]M[/code] 0 ile 1 arasında bir çarpan,
[code]RS[/code] bileşik için gerekli depo alanı (hacim * üretilen/işlenen miktar),
[code]AS[/code] mevcut olan depo alanı,
[code]STORAGE_SPACE_MULTIPLIER[/code] keyfi bir sabittir (şu an için 2.0'dir).

[ul]Daha sonra girenler, depolama alanı dikkate alınarak, YALNIZCA istenen hızın azaltılması kaydıyla, istenen hızın minimumu oranında çıkanlara ve işlemin maksimum kapasitesine (girenlerin ve depolama alanının yeterli olduğu varsayılarak) dönüştürülür. Aksi takdirde, bu alan dikkate alınmaz (bu eylem, işlem sisteminin alan kazanmak için bileşikleri yok etmesini engellemek içindir, o sırada bileşik temizleme kodu bunu yapmalıdır).[/ul]

[b][u]Aşama 3: Talebin Hesaplanması[/u][/b]

[ul]İstenen hızlar bulunduktan sonra, işlem, bileşiklerin talebini belirlemelidir.
Bir bileşiğin talebi, bütün işlemler tarafından oluşturulan taleplerin toplamına eşittir ve bu formül, aşağıdaki denklem ile tanımlanır:[/ul]

[code]D = DR * IN * soft(PC * IN)[/code]

Bununla birlikte:
[code]D[/code] bir işlemden gelen talep,
[code]DR[/code] o işlemden beklenen hız (kapasite olmadığında, giren ürün veya depo alanı kısıtlamaları göz önüne alınır),
[code]IN[/code] işlem tarafından gerekli olan giren ürün (diğer adıyla, işlemi 1 hızında çalıştırmak için harcanan giren ürün miktarı),
[code]PC[/code] maksimum işlem kapasitesi,
[code]soft(x)[/code], x = 0 olduğunda 0'a, x ⟶ ∞ olduğunda 1'e eşit olan ve sürekli, monoton artan bir fonksiyondur.

Mevcut uygulamada:

[code]soft(x) = 2 * sigmoid(x * PROCESS_CAPACITY_DEMAND_MULTIPLIER) - 1[/code]

Bununla birlikte, [code]PROCESS_CAPACITY_DEMAND_MULTIPLIER[/code] keyfi bir sabittir.

[ul]Şunu belirtmek gerekir ki, 2 * x hızındaki A ⟶ B gibi bir işlem, x hızındaki 2 * A ⟶ 2 * B işlemine tamamen eşittir.
Ayrıca, maksimum kapasitesi 0 olan işlemlerin, sistemi hiçbir şekilde etkilemediği de önemlidir.
Hepsi bu kadar! :D[/ul]

WIKI_COMPOUND_SYSTEM_DEVELOPMENT_MICROBE_STAGE

The Microbe Stage takes place in a 3D environment viewed from a 2D perspective, as if being viewed from a microscope. Here, the player must steer their cell into brightly colored compound clouds to sustain and grow their cell until they can reproduce. At the beginning of the game there will be no predators, the only dangers being starvation and the occasional toxin. However, as the player reproduces, new competing species will branch away from the player's species and steadily become an increasingly dangerous obstacle for the player to overcome. While at first the player is a tiny cell only capable of consuming [thrive:compound type="glucose"][/thrive:compound] [thrive:compound type="ammonia"][/thrive:compound] and [thrive:compound type="phosphates"][/thrive:compound], the player will be able to adapt their cell in any way they choose after every reproduction, granting the player new abilities and options as time goes on. This comes at a cost however, as the player cell becomes larger and more complex, it will require more food to sustain. The player must take care to ensure that their cell is always sustainable or they will quickly starve. Additionally, species that arise from your own will inherit your adaptations, so the player must be cautious of how soon they develop things such as weaponry.

[b][u]Controls[/u][/b]

[b][u]Movement[/u][/b]

The Microbe Stage is played using the keyboard and mouse. The cell always faces the mouse cursor's position, while the WASD keys will propel the cell in a direction relative to the cursor's position. For example, pressing the W key will make the cell travel forward towards the mouse cursor. Whereas pressing the S key will make the cell travel backwards away from the mouse cursor. These controls allow the player to strategically move their cell to dodge toxin projectiles or position themselves to catch as many prey cells as they can.The mouse is also used to interact with the various UI elements on the screen.

[b][u]Misc.[/u][/b]

Pressing the G key will enable Engulfment Mode. In this mode, the cell will begin flashing with a blue overlay and damage any cells smaller than them they come into contact with. All cells have this ability, regardless of adaptations so it would be wise to avoid approaching larger cells if the player does not have any defenses.

Pressing the E key will expel a toxin projectile from your cell, should your cell possess toxin generating parts.

Using the mouse wheel, the player can adjust their field of view. This is very useful for navigating the environment around them or taking a close look at their cell.

Pressing X will enable auto-move, causing the player to move forward automatically. This frees the player from continuously holding down the movement keys when they do not have a need for fine control. The player can still steer using the mouse while in this state, and can cancel auto-move at any time by pressing any movement key.

[b][u]Environment[/u][/b]

[b][u]Physical Conditions[/u][/b]

These are unique parameters that relate to the climate of the current patch and act as a passive effect on the cells.

[ul][b]Temperature:[/b] The measure of heat in the current environment. Temperature currently has no direct effect on cells, but is needed to generate energy using thermoplasts.[/ul]

[ul][b]Pressure:[/b] The amount of crushing force in the environment due to depth. Pressure currently has no effect in the game.[/ul]

[ul][b]Lux:[/b] The amount of light reaching the environment. Lux is vital for photosynthesis to function, so photosynthesizers should make sure that the environment they inhabit has enough light to support them. 50% lux and above makes for a perfectly suitable home for photosynthesizers.[/ul]

[b][u]Atmospheric Gasses[/u][/b]

These are gasses that are present within a patch and do not have a physical presence in the game world. These elements act as a passive effect on various processes of the cell and can be required for certain proteins and organelles to function.

[thrive:compound type="oxygen"][/thrive:compound] [b]Oxygen:[/b] An important gas for aerobic respiration, [b]Oxygen[/b] is used by parts such as [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:metabolosome]Metabolosomes[/url][/color][/b] to perform their purposes. The more [b]Oxygen[/b] that is present in a patch, the better these parts will perform. Currently, [b]Oxygen[/b] has no other effect on cells. The concentration starts at 0% in all patches, increases by frequency of photosynthesis, and decreases by frequency of respiration, aerobic [thrive:compound type="nitrogen"][/thrive:compound] fixation and some toxin synthesis.

[thrive:compound type="nitrogen"][/thrive:compound] [b]Nitrogen:[/b] A gas used by cells for [b]Nitrogen[/b] fixation in the synthesis of [thrive:compound type="ammonia"][/thrive:compound]. [b]Nitrogen[/b] currently has no other effect on cells. Concentration decreases by frequency of [b]Nitrogen[/b] fixation.

[thrive:compound type="carbondioxide"][/thrive:compound] [b]Carbon Dioxide:[/b] An important gas for chemosynthesis and photosynthesis. [b]Carbon Dioxide[/b] currently starts at a concentration from 8% to 30% in different patches. The concentration decreases by frequency of photosynthesis and [thrive:compound type="iron"][/thrive:compound] or [thrive:compound type="hydrogensulfide"][/thrive:compound] chemosyntheis, and increases by frequency of respiration.

[b][u]Compounds[/u][/b]

There are several compounds present in the Microbe Stage. Below is a list of all compounds and their uses.

[thrive:compound type="glucose"][/thrive:compound] [b]Glucose:[/b] Primary [thrive:compound type="atp"][/thrive:compound] storage for cells, and initial source of food for the player. [b]Glucose[/b] is consumed by several organelles and proteins to produce [thrive:compound type="atp"][/thrive:compound], the most notable being the [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:metabolosome]Metabolosomes[/url][/color][/b] and [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:mitochondrion]Mitochondrion[/url][/color][/b] as they are specifically used for [b]Glucose[/b]. When the player dies they will respawn with a reserve of [b]Glucose[/b] within their cell, allowing them to readily resume gameplay without fear of starvation. The player must take care should they rely on the readily available [b]Glucose[/b] found in the environment, as every generation the global [b]Glucose[/b] amounts decrease. [b]Glucose[/b] clouds are white in color.

[thrive:compound type="ammonia"][/thrive:compound] [b]Ammonia:[/b] Vital compounds required for reproduction. [b]Ammonia[/b] is used to grow and copy the proteins and organelles within the cell and can be found readily throughout the environment. Parts such as the [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:nitrogenase]Nitrogenase[/url][/color][/b] and [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:nitrogenfixingplastid]Nitroplast[/url][/color][/b] can produce [b]Ammonia[/b] from [thrive:compound type="atp"][/thrive:compound] and [thrive:compound type="nitrogen"][/thrive:compound], saving the player from having to actively seek it out in the environment to reproduce. [b]Ammonia[/b] clouds are orange in color.

[thrive:compound type="phosphates"][/thrive:compound] [b]Phosphate:[/b] Identical in purpose to [thrive:compound type="ammonia"][/thrive:compound], [b]Phosphate[/b] is a requirement for reproduction. Unlike [thrive:compound type="ammonia"][/thrive:compound], however, there are no methods of synthesizing [b]Phosphate[/b] so it can only be found in the environment or from predation. [b]Phosphates[/b] clouds are purple in color. [b]Phosphates[/b] crystals are blue or blue-green.

[thrive:compound type="hydrogensulfide"][/thrive:compound] [b]Hydrogen Sulfide:[/b] An alternative source of [thrive:compound type="glucose"][/thrive:compound] for cells, that can be found in high quantities in a select few patches. Should a player intend to use [b]Hydrogen Sulfide[/b] for energy, they must take care to ensure that the patch they inhabit contains the compound. [b]Hydrogen Sulfide[/b] is only usable if the player possesses [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:chemoSynthesizingProteins]Chemosynthesizing Proteins[/url][/color][/b], otherwise the player cannot take in the compound, and any already stored within the cell will be quickly expelled.

[thrive:compound type="iron"][/thrive:compound] [b]Iron:[/b] Another alternative source of [thrive:compound type="atp"][/thrive:compound], [b]Iron[/b] is a relatively uncommon resource found in almost, but not all, patches in the world. Unlike any other compound, [b]Iron[/b] can not only be found in clouds but also as variably sized chunks that trail [b]Iron[/b] clouds as they drift. [b]Iron[/b] can only be used by a cell if it possesses [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:rusticyanin]Rusticyanin[/url][/color][/b]. [b]Iron[/b] clouds appear brown in color. The chunks themselves can be engulfed for a significant source of [b]Iron[/b].

Mikrop Evresi, mikroskoptan bakılıyormuş gibi 2D bir perspektiften görülen 3D bir ortamda gerçekleşir. Burada oyuncu, hücresini renkli bileşik bulutlarına yönlendirerek, çoğalabilecek hale gelene kadar hücresini yaşatmalı ve büyütmelidir. Oyunun başında hiçbir yırtıcı canlı yoktur, tek tehlike açlık ve ara sıra karşılaşılan toksinlerdir. Ancak oyuncu çoğaldıkça, rakip türler oyuncu türünden dallanarak ayrılırlar ve oyuncunun üstesinden gelmesi gereken giderek daha tehlikeli engeller haline gelirler. Oyuncu, ilk başta sadece [thrive:compound type="glucose"]glukoz[/thrive:compound], [thrive:compound type="ammonia"]amonyak[/thrive:compound] ve [thrive:compound type="phosphates"]fosfat[/thrive:compound] tüketebilen küçük bir hücreyken, her çoğalma sonrası hücresini istediği şekilde uyarlayabilir, böylece zamanla yeni yetenekler ve seçenekler kazanabilir. Ancak, bu bir bedelle gelir; oyuncu hücresi büyüdükçe ve daha karmaşık hale geldikçe, kendini sürdürmek için daha fazla besine ihtiyaç duyar. Oyuncu, hücresinin her zaman sürdürülebilir olduğundan emin olmalıdır, aksi takdirde hücre çabucak açlıktan ölür. Ayrıca, oyuncu türünden türeyen türler, oyuncunun adaptasyonlarını miras alacakları için, oyuncu silahlanma gibi özellikleri ne zaman geliştireceğine dikkat etmelidir.

[b][u]Kontroller[/u][/b]

[b][u]Hareket[/u][/b]

Mikrop Evresi, klavye ve fare kullanılarak oynanır. Hücre, her zaman fare imlecine doğru yönelir, WASD tuşları ise hücreyi fare imlecinin konumuna göre bir yöne doğru hareket ettirir. Örneğin, W tuşuna basmak hücreyi fare imlecine doğru, ileri götürürken, S tuşuna basmak hücreyi fare imlecinden uzağa, geri götürür. Bu kontroller, oyuncunun hücresini stratejik olarak hareket ettirerek toksin mermilerinden sıyrılmasına veya mümkün olduğu kadar av hücresini yakalayacak şekilde pozisyon almasını sağlar. Fare ayrıca ekrandaki çeşitli kullanıcı arayüzü (UI) öğeleriyle etkileşim kurmak için de kullanılır.

[b][u]Diğer[/u][/b]

G tuşuna basmak Yutma Modunu etkinleştirir. Bu modda hücre, etrafında mavi bir tabaka ile yanıp söner ve kendinden küçük hücrelere temas ettiğinde hasar verir. Adaptasyonlara bakılmaksızın, bütün hücreler bu yeteneğe sahiptir. Bu nedenle, oyuncunun herhangi bir savunması yoksa daha büyük hücrelerden uzak durması akıllıca olacaktır.

Eğer hücrenizin toksin üreten parçaları varsa, E tuşuna basmak hücrenizden bir toksin mermisi fırlatır.

Fare tekerleğini kullanarak oyuncu görüş alanını ayarlayabilir. Bu kontrol, oyuncunun etrafındaki ortamı seyretmesi veya hücresine yakından bakması için oldukça kullanışlıdır.

X tuşuna basmak otomatik hareketi etkinleştirir ve oyuncunun hücresini otomatik olarak ileri hareket ettirir. Bu kontrol, hassas kontrol gerekmediğinde oyuncunun sürekli hareket tuşlarına basmasını önler. Bu durumdayken oyuncu hala fareyi kullanarak hücreyi yönlendirebilir ve herhangi bir hareket tuşuna basarak otomatik hareketi her an iptal edebilir.

[b][u]Ortam[/u][/b]

[b][u]Fiziksel Koşullar[/u][/b]

Aşağıdaki parametreler, mevcut arazinin iklimiyle ilgili benzersiz parametrelerdir ve hücreler üzerinde pasif bir etki olarak işlev görür.

[ul][b]Sıcaklık:[/b] Mevcut ortamın ısısının ölçüsüdür. Sıcaklık şu an için hücreler üzerinde doğrudan bir etkiye sahip değildir, ancak termoplastları kullanarak enerji üretmek için gereklidir.[/ul]

[ul][b]Basınç:[/b] Ortamda, derinliğe bağlı olarak oluşan baskı kuvvetidir. Basınç şu an için oyunda bir etkiye sahip değildir.[/ul]

[ul][b]Işık Şiddeti:[/b] Ortama ulaşan ışık miktarıdır. Işık şiddeti, fotosentez için hayati bir öneme sahiptir. Bu yüzden fotosentez yapan hücreler, bulundukları ortamın onları destekleyecek kadar ışık içerdiğinden emin olmalıdır. %50 lux ve üzeri, fotosentez yapan hücreler için tamamen uygun bir yuva sağlar.[/ul]

[b][u]Atmosferik Gazlar[/u][/b]

Aşağıdaki gazlar, bir arazi içerisinde bulunan ve oyun dünyasında fiziksel bir varlığı olmayan gazlardır. Bu elementler, hücrelerin çeşitli işlemleri üzerinde pasif bir etki yaratır ve bazı proteinlerin ve organellerin çalışması için gerekli olabilir.

[thrive:compound type="oxygen"]Oksijen[/thrive:compound] [b]Oksijen:[/b] Oksijenli solunum için önemli bir gazdır. [b]Oksijen[/b], [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:metabolosome]Metabolozomlar[/url][/color][/b] gibi parçaların işlevlerini yerine getirmesi için kullanılır. Bir arazide ne kadar çok [b]Oksijen[/b] varsa, bu parçalar o kadar iyi çalışır. Şu an için, [b]Oksijenin[/b] hücreler üzerinde başka bir etkisi yoktur. Konsantrasyon, bütün arazilerde %0'da başlar, fotosentez sıklığı ile artar ve solunum, oksijenli [thrive:compound type="nitrogen"]Azot[/thrive:compound] fiksasyonu ve bazı toksin sentezlerinin sıklığı ile azalır.

[thrive:compound type="nitrogen"]Azot[/thrive:compound] [b]Azot:[/b] [thrive:compound type="ammonia"]Amonyak[/thrive:compound] sentezinde, [b]Azot[/b] fiksasyonu için hücreler tarafından kullanılan bir gazdır. Şu an için, [b]Azotun[/b] hücreler üzerinde başka bir etkisi yoktur. Konsantrasyon, [b]Azot[/b] fiksasyonu sıklığı ile azalır.

[thrive:compound type="carbondioxide"]Karbondioksit[/thrive:compound] [b]Karbondioksit:[/b] Kemosentez ve fotosentez için önemli bir gazdır. [b]Karbondioksit[/b], şu an için, farklı arazilerde %8 ila %30 arasında değişen bir konsantrasyonda başlar. Konsantrasyon, fotosentez ve [thrive:compound type="iron"]Demir[/thrive:compound] ya da [thrive:compound type="hydrogensulfide"]Hidrojen Sülfür[/thrive:compound] kemosentezi sıklığı ile azalır ve solunum sıklığı ile artar.

[b][u]Bileşikler[/u][/b]

Mikrop Evresi'nde bulunan birçok bileşik vardır. Aşağıda, tüm bileşiklerin ve kullanım amaçlarının bir listesi bulunmaktadır.

[thrive:compound type="glucose"]Glukoz[/thrive:compound] [b]Glukoz:[/b] Hücreler için birincil [thrive:compound type="atp"]ATP[/thrive:compound] depolama kaynağı ve oyuncunun ilk besin kaynağıdır. [b]Glukoz[/b], ATP üretmek için birkaç organel ve protein tarafından tüketilir. Bunlar arasında en dikkat çekici olanlar [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:metabolosome]Metabolozomlar[/url][/color][/b] ve [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:mitochondrion]Mitokondrilerdir[/url][/color][/b], çünkü özellikle [b]Glukoz[/b] için kullanılırlar. Oyuncu öldüğünde, hücresinde bir [b]Glukoz[/b] rezerviyle yeniden doğar ve açlık korkusu olmadan oyuna rahatlıkla devam edebilir. Oyuncu, ortamda bulunan kolayca erişilebilir [b]Glukoza[/b] güveniyorsa dikkatli olmalıdır, çünkü her kuşakta genel [b]Glukoz[/b] miktarı azalır. [b]Glukoz[/b] bulutları beyaz renktedir.

[thrive:compound type="ammonia"]Amonyak[/thrive:compound] [b]Amonyak:[/b] Üreme için önemli bir bileşiktir. [b]Amonyak[/b], hücre içindeki proteinlerin ve organellerin büyümesi ve çoğaltılması için kullanılır ve ortamda kolaylıkla bolca bulunabilir. [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:nitrogenase]Nitrojenaz[/url][/color][/b] ve [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:nitrogenfixingplastid]Nitroplast[/url][/color][/b] gibi parçalar, [thrive:compound type="atp"]ATP[/thrive:compound] ve [thrive:compound type="nitrogen"]Azottan[/thrive:compound] [b]Amonyak[/b] üretebilir. Bu da oyuncuyu, kendisinin çoğalması için, ortamda aktif olarak bu bileşiği arama zorunluluğundan kurtarır. [b]Amonyak[/b] bulutları turuncu renktedir.

[thrive:compound type="phosphates"]Fosfat[/thrive:compound] [b]Fosfat:[/b] [thrive:compound type="ammonia"]Amonyak[/thrive:compound] ile aynı amaca hizmet eden, [b]Fosfat[/b] da üreme için gereklidir. Ancak [thrive:compound type="ammonia"]Amonyaktan[/thrive:compound] farklı olarak [b]Fosfatın[/b] sentezlenmesi için herhangi bir yöntem yoktur. Bu nedenle, bu bileşik yalnızca ortamda bulunabilir veya avlanma ile elde edilebilir. [b]Fosfat[/b] bulutları mor renktedir. [b]Fosfat[/b] kristalleri mavi yada mavi-yeşil renktedir.

[thrive:compound type="hydrogensulfide"]Hidrojen Sülfür[/thrive:compound] [b]Hidrojen Sülfür:[/b] Hücreler için alternatif bir [thrive:compound type="glucose"]Glukoz[/thrive:compound] kaynağıdır ve yalnızca birkaç arazide bol miktarda bulunabilir. Eğer oyuncu enerji için [b]Hidrojen Sülfür[/b] kullanmayı düşünüyorsa, bulunduğu arazinin bu bileşiği içerdiğinden emin olmalıdır. [b]Hidrojen Sülfür[/b] yalnızca, eğer oyuncu [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:chemoSynthesizingProteins]Kemosentez Yapan Proteinlere[/url][/color][/b] sahipse, kullanılabilir. Aksi takdirde, oyuncu bu bileşiği alamaz ve hücre içinde halihazırda depolanan bu bileşik hızla dışarı atılır.

[thrive:compound type="iron"]Demir[/thrive:compound] [b]Demir:[/b] Alternatif bir [thrive:compound type="atp"]ATP[/thrive:compound] kaynağı olan [b]Demir[/b], dünyadaki hemen hemen her arazi içinde bulunabilen ancak nispeten nadir bir bileşiktir. Diğer bileşiklerden farklı olarak, [b]Demir[/b] yalnızca bulutlar halinde değil, aynı zamanda [b]Demir[/b] bulutlarını takip eden ve sürüklenen farklı büyüklükteki parçalar olarak da bulunabilir. [b]Demir[/b] yalnızca hücrede [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:rusticyanin]Rustisiyanin[/url][/color][/b] varsa kullanılabilir. [b]Demir[/b] bulutları kahverengi olarak görünür. Bu parçalar, önemli miktarda [b]Demir[/b] kaynağı almak için yutulabilir.

WIKI_MICROBE_STAGE_GAMEPLAY

The editor is the strategic side of the microbial stage and is accessed whenever the player reproduces. It is in this editor that the player is allowed to evolve their species by placing parts from a list of available proteins or organelles onto their cell. Each generation, the player is given 100 Mutation points or MP that is used as a currency to buy these parts. The editor is currently divided into three different windows; The report page, the patch map, and finally the editor itself.

[b][u]Report[/u][/b]

The report menu is the first page the player will see upon entering the editor. This page describes all environmental changes that had taken place before entering the editor such as changes in species population, compound concentration, and etc. The information provided in the report can be helpful, but is not a necessity for performing well in the game, so players need not concern themselves with analyzing its contents.

[b][u]Patch Map[/u][/b]

The second page a player will visit is the patch map. This menu displays what is essentially the world map, with patches representing biomes the player can visit interconnected by lines that represent traversable paths. The player can select each visible patch to display the environmental statistics of that biome, such as compound concentration, species present, and so on. Should the selected patch be connected to the player's occupied patch via a path, the player will be able to choose to play in the selected patch upon leaving the editor.Players who intend to move to new environments should take care and inspect a patch before moving to it to ensure they are prepared for what is to come.

[b][u]Patches[/u][/b]

Below is a complete list of the various patch varieties currently in the game.

[ul]Abyssopelagic
Bathypelagic
Mesopelagic
Epipelagic
Sea Floor
Tidepool
Estuary
vents
Coast
Ice Shelf
Caves[/ul]

[b][u]Biomes[/u][/b]

[i]Main Article: <a href="/wiki/Microbe_Biomes" title="Microbe Biomes">Microbe Biomes</a>[/i]

Each patch represents a certain biome. The biome defines the physical properties of that patch, such as the temperature, pressure, and light levels.

[b][u]Cell editor[/u][/b]

The editor page is where the player will be able to customize their cell part by part. The majority of the editor is taken up by a hex field where the cell parts are placed, with the center being occupied by the player's current cell. To the left of this large space is the part list where the player will select parts to place on their cell, or otherwise change its qualities such as color or membrane type. The top right space is occupied by the organism statistics describing what the cell is capable of, as well as including the [thrive:compound type="atp"][/thrive:compound] balance bar which informs the player on the amount of [thrive:compound type="atp"][/thrive:compound] they produce versus how much they consume. The player should always make sure that the red bar is shorter than the green bar, or else they will meet an untimely demise of their own creation. In the bottom right, players will find the autoevo prediction screen which details how well their species is expected to perform with the changes they make according to the autoevo algorithm. Finally, the top left of the editor contains the tabs used to navigate between the previous pages, as well as the MP bar that displays the player's current bank of MP.

The player is able to place new parts or hexes adjacent to any preexisting occupied hex, or atop a cytoplasm hex to replace it with a new part. Should the player desire to, they can delete parts of their cell by right-clicking placed parts at a cost of 10 MP per deletion. Alternatively, the player can use the arrow buttons located at the bottom of the editor screen to undo or redo previous actions, however this functionality will only work on changes made in the current editor section. The button in the middle of the arrow buttons is the symmetry key, which when clicked will change the player's current symmetry mode. All parts can be deleted except for three exceptions, the nucleus, binding agents, and the last hex of the cell. These parts can still be moved however, so don't stress if you don't like it's current position!

The cell editor contains three different tabs, each with a unique function.

[b][u]Structure[/u][/b]

The structure tab contains all of the parts the player can choose from such as proteins, organelles, and extracellular structures like the pili. The player must click on their desired part icon to select it, and then click where they want to place it within the hex field to add the part to their organism.The structure tab is divided into three categories; [b]prokaryotic structures[/b], [b]external organelles[/b], and [b]internal organelles[/b]. Internal organelles in particular cannot be used by the player until they have evolved the nucleus. The player can also freely modify, delete, or otherwise relocate placed parts while in the structure tab.

[b][u]Membrane[/u][/b]

The membrane tab contains options for customizing the cell's membrane. Here, the player is presented with a list of buttons representing various membrane and cell wall varieties, each with unique stats and abilities. In order to select a membrane type, the player need only ensure they have enough MP and click the desired type. The player is also granted a slider that adjusts fluidity and rigidity at the cost of 2 MP per change. The more fluid a cell is the faster and fragile it is, while rigid cells are durable but slow.At the bottom of the membrane tab is the color wheel, which allows the player to choose which color their cell will be. This feature is entirely cosmetic and does not cost any MP to change.

[b][u]Behavior[/u][/b]

The behavior tab presents the player with a list of behavioral scales and sliders to adjust them with. Adjusting these sliders allows the player to control how their species AI responds to the world around them, but currently does not effect the player themselves. Each slider represents two extremes of a personality scale, the position of which determining how far a species leans in either attitude.

The current personality scales are;

[ul]Peaceful/Aggressive: Determining how hostile or ambivalent a species is towards other species.
Cautious/Opportunistic: Determining how willing a species is to endanger themselves for potential gain.
Brave/Fearful: Determining how willing a species is to flee from perceived threats, and how threatening they need to be.
Sessile/Active: Determining how willing a species is to move, if at all, without stimulus.
Responsive/Focused: Determining how quickly a species gives up pursuing a goal, if ever.[/ul]

Editör, mikrobiyal evrenin stratejik tarafıdır ve oyuncu çoğaldığında erişilir. Bu editörde, mevcut proteinler veya organeller listesindeki parçaları hücresine yerleştirerek, oyuncuya türünü evrimleştirme imkanı verilir. Her kuşakta, oyuncunun bu parçaları satın alması için kullanılan bir para birimi olan 100 Mutasyon Puanı veya MP verilir. Editör, şu an için, üç farklı pencereye bölünmüştür: Rapor sayfası, arazi haritası ve son olarak editörün kendisi.

[b][u]Rapor[/u][/b]

Rapor menüsü, oyuncunun editöre girdiğinde göreceği ilk sayfadır. Bu sayfa, editöre girmeden önce gerçekleşmiş, türlerin popülasyonundaki değişimler, bileşik miktarı vb. tüm çevresel değişiklikleri tanımlar. Raporun sağladığı bilgiler faydalı olabilir ama oyunda iyi bir performans göstermek için zorunlu değildir. Bu yüzden, oyuncular, rapor içeriğini analiz etmekle ilgilenmek zorunda değiller.

[b][u]Arazi Haritası[/u][/b]

Oyuncunun ziyaret edeceği ikinci sayfa, arazi haritasıdır. Bu menü, dünya haritası olarak nitelendirilebilecek bir yapıyı gösterir; araziler, oyuncunun ziyaret edebileceği biyomları temsil eder ve bu araziler, geçilebilir yolları gösteren hatlarla birbirine bağlanır. Oyuncu, herhangi bir görünür araziyi seçerek o biyomun, bileşik miktarı, bulunan türler, vb. çevresel istatistiklerini görüntüleyebilir. Seçilen arazi, oyuncunun bulunduğu araziye bir yol aracılığıyla bağlıysa, oyuncu editörden ayrıldığında seçilen arazide oynamayı tercih edebilir. Yeni ortamlara gitmek isteyen oyuncular, neler olacağına dair hazırlıklı olmak için bir araziye gitmeden önce dikkatli olmalı ve bu araziyi incelemelidir.

[b][u]Araziler[/u][/b]

Aşağıda, şu an oyunda bulunan çeşitli arazi türlerinin tam listesi verilmiştir:

[ul]Abissopelajik
Betipelajik
Mezopelajik
Epipelajik
Deniz Tabanı
Gelgit Havuzu
Haliç
Volkan Bacaları
Sahil
Buz Sahanlığı
Mağaralar[/ul]

[b][u]Biyomlar[/u][/b]

[i]Ana Makale: <a href="/wiki/Microbe_Biomes" title="Microbe Biomes">Mikrop Biyomları</a>[/i]

Her arazi belirli bir biyomu temsil eder. Biyom, bu arazinin sıcaklık, basınç ve ışık seviyeleri gibi fiziksel özelliklerini tanımlar.

[b][u]Hücre Editörü[/u][/b]

Editör sayfası, oyuncunun hücresini parça parça özelleştirebileceği bir yerdir. Editörün büyük bir kısmı, hücre parçalarının yerleştirildiği altıgen bir alandan oluşur ve merkezde oyuncunun mevcut hücresi yer alır. Bu geniş alanın sol tarafında, oyuncunun hücresine eklemek istediği parçaları seçebileceği parça listesi veya renk ya da zar türü gibi özellikleri değiştirebileceği bir sekme bulunur. Sağ üst alan, hücrenin neler yapabileceğini tanımlayan organizma istatistiklerini ve de oyuncuya, ürettiği [thrive:compound type="atp"]ATP[/thrive:compound] miktarı ile tükettiği miktar arasındaki dengeyi gösteren [thrive:compound type="atp"]ATP[/thrive:compound] tutarı çubuğunu içerir. Oyuncu, her zaman kırmızı çubuğun yeşil çubuktan daha kısa olduğundan emin olmalıdır. Aksi takdirde, oyuncular kendi canlılarının zamansız ölümü ile karşılaşabilir. Sağ altta, oyuncular, oto-evrim algoritmasına göre yaptıkları değişikliklerle türlerinin performansının ne kadar iyi olacağını tahmini olarak detaylandıran oto-evrim tahmin ekranını bulacaktır. Son olarak, editörün sol üstü, önceki sayfalar arasında gezinmek için kullanılan sekmeler ve oyuncunun mevcut MP miktarını gösteren MP çubuğunu içerir.

Oyuncu, mevcut ve dolu olan herhangi bir altıgenin bitişiğine veya bir sitoplazma altıgeninin üzerine yeni parçalar yerleştirerek, eski parçayı yenisiyle değiştirebilir. Oyuncu isterse, yerleştirilen parçaları 10 MP silme maliyeti ile sağ tıklayarak silebilir. Alternatif olarak oyuncu, editör ekranının altındaki ok butonlarını kullanarak önceki eylemleri geri alabilir veya yineleyebilir. Ancak bu işlev, yalnızca mevcut editör sürecinde yapılan değişiklikler için geçerlidir. Ok butonlarının ortasındaki buton simetri tuşudur ve bu buton tıklandığında oyuncunun mevcut simetri modunu değiştirir. Üç istisna hariç, tüm parçalar silinebilir: Çekirdek, bağlayıcı ajanlar ve hücrenin son altıgeni. Ama bu parçalar yine de taşınabilir, bu yüzden parçaların mevcut konumunu beğenmiyorsanız endişelenmeyin!

Hücre editörü, her biri benzersiz bir işleve sahip üç farklı sekme içerir.

[b][u]Yapı[/u][/b]

Yapı sekmesi, oyuncunun proteinler, organeller ve pili gibi hücre dışı yapılar seçebileceği tüm parçaları içerir. Oyuncu, istediği parçanın simgesine tıklayarak onu seçmeli ve, ardından, bu parçayı organizmasına eklemek için altıgen alan içinde istediği yere tıklamalıdır. Yapı sekmesi üç kategoriye ayrılır: [b]Prokaryotik yapılar[/b], [b]dış organeller[/b] ve [b]iç organeller[/b]. Özellikle iç organeller, oyuncu çekirdeği evrimleştirene dek kullanılamaz. Oyuncu yapı sekmesindeyken, yerleştirilen parçalarda kolayca değişiklik yapabilir, bu parçaları silebilir veya yerini değiştirebilir.

[b][u]Hücre Zarı[/u][/b]

Hücre zarı sekmesi, hücrenin zarını özelleştirme seçenekleri sunar. Burada oyuncuya, her biri benzersiz istatistik ve yeteneklere sahip çeşitli hücre zarı ve hücre duvarı türlerini gösteren butonlardan oluşan bir liste sunulur. Oyuncunun bir zar türünü seçmesi için yalnızca yeterli MP'ye sahip olduğundan emin olması ve istediği türe tıklaması gerekir. Ayrıca oyuncuya, 2 MP karşılığında, akışkanlığı ve sertliği ayarlayan bir kaydırma butonu da sunulur. Bir hücre ne kadar akışkan ise, o kadar hızlı ve hassastır; sert hücreler ise, dayanıklı ama yavaştır. Hücre zarı sekmesinin en altında, oyuncunun, kendi hücresinin rengini seçebileceği bir renk paleti bulunur. Bu özellik, tamamen kozmetiktir ve bu özelliğin değiştirilmesi MP gerektirmez.

[b][u]Davranış[/u][/b]

Davranış sekmesi, oyuncuya davranışsal ölçeklerin bir listesini ve bunları ayarlayabileceği kaydırma butonları sunar. Bu kaydırma butonlarını ayarlamak, bilgisayar tarafından kontrol edilen oyuncu türlerinin etraflarındaki dünyaya nasıl karşılık vereceklerini kontrol etmesine olanak tanır. Ancak bu ayar, şu an için, oyuncunun kendi hücresini etkilemez. Her bir kaydırma butonu, bir kişilik ölçeğinin iki uç noktasını temsil eder ve butonun konumu, bir türün hangi tutuma ne kadar eğilimli olduğunu belirler.

Mevcut kişilik ölçekleri şunlardır:

[ul]Barışçıl/Saldırgan: Türün diğer türlere karşı ne kadar düşmanca veya ilgisiz olduğunu belirler.
Temkinli/Fırsatçı: Potansiyel kazanç için türün kendini tehlikeye atmaya ne kadar istekli olduğunu belirler.
Cesur/Kaygılı: Türün algıladığı tehditlerden kaçmaya ne kadar istekli olduğunu ve ne kadar tehditkar olması gerektiğini belirler.
Durağan/Hareketli: Türün, mümkünse herhangi bir uyarıcı olmadan, hareket etmeye ne kadar istekli olduğunu belirler.
Duyarlı/Odaklı: Eğer tür bir hedefi kovalıyorsa, bu hedefin peşini ne kadar çabuk bırakacağını belirler.[/ul]

WIKI_MICROBE_STAGE_EDITOR

A cell must have a [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:nucleus]Nucleus[/url][/color][/b] to evolve [b]Toxin Vacuoles[/b].

If organelle upgrades are enabled in game settings, [i]both[/i] of the following conditions must be true [i]for the player cell[/i]:

[ul]Has engulfed at least [b]10[/b] cells throughout the game so far.
Contains at least [b]1[/b] [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:oxytoxyProteins]Oxytoxisome[/url][/color][/b] for at least [b]5[/b] generations in a row.[/ul]

Bir hücre, [b]Toksin Kofullarını[/b] evrimleştirmek için [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:nucleus]Çekirdeğe[/url][/color][/b] sahip olmalıdır.

Eğer organel geliştirmeleri oyun ayarlarından etkinleştirildiyse, aşağıdaki koşulların [i]her ikisi de[/i] [i]oyuncu hücresi[/i] için doğru olmalıdır:

[ul]Oyun sırasında, şu ana kadar en az [b]10[/b] hücre yutmuş olmak.
Üst üste en az [b]5[/b] kuşak boyunca en az [b]1[/b] [b][color=#3796e1][url=thriveopedia:oxytoxyProteins]Oksitoksizom[/url][/color][/b] içermek.[/ul]

WIKI_TOXIN_VACUOLE_REQUIREMENTS

If organelle upgrades are enabled in game settings, the following condition must be true [i]for the player cell[/i]:

[ul]Is in a patch with at least [b]20%[/b] [thrive:compound type="sunlight"][/thrive:compound].[/ul]

Eğer organel geliştirmeleri oyun ayarlarından etkinleştirildiyse, aşağıdaki şart [i]oyuncu hücresi[/i] için doğru olmalıdır:

[ul]En az [b]%20[/b] [thrive:compound type="sunlight"]Güneş Işığına[/thrive:compound] sahip bir arazide olmak.[/ul]

WIKI_THYLAKOIDS_REQUIREMENTS

[b]Thermosynthase[/b] only appears in games with "LAWK" turned off in game settings.If [i]organelle unlocks[/i] are enabled in game settings, the organelle will be unlocked once the following condition has been met [i]for the player cell[/i]:

[ul]Is in a patch with at least [b]50 °C[/b] [thrive:compound type="temperature"][/thrive:compound].[/ul]

[b]Termosentaz[/b], yalnızca oyun ayarlarında "BH" seçeneği devre dışı olan oyunlarda görülür. Eğer [i]organellerin kilidini açma[/i] seçeneği oyun ayarlarından etkinleştirildiyse, aşağıdaki şart [i]oyuncu hücresi[/i] için karşılandığında bu organelin kilidi açılır:

[ul]En az [b]50 °C[/b] [thrive:compound type="temperature"]sıcaklığa[/thrive:compound] sahip bir arazide olmak.[/ul]

WIKI_THERMOSYNTHASE_REQUIREMENTS